A Estação Ecológica tem como objetivo a preservação da natureza e a realização de pesquisas científicas.
Quanto aos Parques Nacionais, possuem o objetivo básico de garantir a preservação de ecossistemas naturais de grande relevância ecológica e beleza cênica, possibilitando a realização de pesquisas científicas e o desenvolvimento de atividades de educação e interpretação ambiental, de recreação em contato com a natureza e de turismo ecológico. Cabe lembrar que as unidades dessa categoria, quando criadas pelo Estado ou Município, serão denominadas, respectivamente, Parque Estadual e Parque Natural Municipal.