Para que uma empresa obtenha e manutenha a certificação ambiental, ISO 14000, a organização deverá se submeter periodicamente a auditorias ambientais, realizadas por empresa certificadora, credenciada e reconhecida pelo INMETRO e outros organismos internacionais.
Em uma auditoria ambiental são levados em conta o cumprimento de requisitos como: o cumprimento da legislação ambiental; o diagnóstico atualizado dos aspectos e impactos ambientais de cada atividade; os procedimentos padrões e planos de ação para eliminar ou diminuir os impactos ambientais sobre os aspectos ambientais e pessoal devidamente treinado e qualificado.